ポンプマンの弱点は、サンダーウールの電撃。サンダーウールの雲を直接当ててもダメージは少ないが、電撃を当てると大ダメージ。また、ポンプマンの張ったウォーターシールドも剥がしてくれる。ただし、サンダーウールの電撃を当てるのは結構むずかしく、サンダーウールを発射できる数も少ないので、ポンプマンがウォーターシールドを発射する前にしっかりと当てることが必要。

サンダーウールを当てるタイミングは、ポンプマンがウォーターシールドを張っている時や、垂直にジャンプした時。